MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 plasmid pVir

Total Repeats: 961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017284	A	6	6	19	24	100 %	0 %	0 %	0 %	384448935
2	NC_017284	GA	3	6	49	54	50 %	0 %	50 %	0 %	384448935
3	NC_017284	ATT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448935
4	NC_017284	AAG	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448935
5	NC_017284	T	7	7	169	175	0 %	100 %	0 %	0 %	384448935
6	NC_017284	TTA	2	6	241	246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448935
7	NC_017284	A	6	6	271	276	100 %	0 %	0 %	0 %	384448935
8	NC_017284	GAT	2	6	298	303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448935
9	NC_017284	GA	3	6	307	312	50 %	0 %	50 %	0 %	384448935
10	NC_017284	A	7	7	338	344	100 %	0 %	0 %	0 %	384448935
11	NC_017284	TG	3	6	345	350	0 %	50 %	50 %	0 %	384448935
12	NC_017284	TAA	2	6	444	449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448935
13	NC_017284	CGAT	2	8	461	468	25 %	25 %	25 %	25 %	384448935
14	NC_017284	A	7	7	513	519	100 %	0 %	0 %	0 %	384448935
15	NC_017284	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448935
16	NC_017284	T	6	6	535	540	0 %	100 %	0 %	0 %	384448935
17	NC_017284	CTTA	2	8	559	566	25 %	50 %	0 %	25 %	384448935
18	NC_017284	A	6	6	579	584	100 %	0 %	0 %	0 %	384448935
19	NC_017284	ATT	2	6	625	630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448935
20	NC_017284	TAA	2	6	645	650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448935
21	NC_017284	ACA	2	6	654	659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448935
22	NC_017284	ACA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448936
23	NC_017284	AAT	2	6	819	824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448936
24	NC_017284	CAAGGG	2	12	864	875	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384448936
25	NC_017284	TACT	2	8	932	939	25 %	50 %	0 %	25 %	384448936
26	NC_017284	T	6	6	1032	1037	0 %	100 %	0 %	0 %	384448936
27	NC_017284	A	8	8	1039	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	384448936
28	NC_017284	A	6	6	1099	1104	100 %	0 %	0 %	0 %	384448936
29	NC_017284	AGA	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448936
30	NC_017284	CTT	2	6	1255	1260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448936
31	NC_017284	CTT	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448936
32	NC_017284	TACA	2	8	1350	1357	50 %	25 %	0 %	25 %	384448936
33	NC_017284	TTAA	2	8	1377	1384	50 %	50 %	0 %	0 %	384448936
34	NC_017284	ATT	2	6	1411	1416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448936
35	NC_017284	AAG	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448936
36	NC_017284	A	7	7	1452	1458	100 %	0 %	0 %	0 %	384448936
37	NC_017284	A	7	7	1490	1496	100 %	0 %	0 %	0 %	384448936
38	NC_017284	CGA	2	6	1499	1504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448936
39	NC_017284	TTA	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448936
40	NC_017284	GAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448936
41	NC_017284	A	6	6	1536	1541	100 %	0 %	0 %	0 %	384448936
42	NC_017284	GACAAA	2	12	1560	1571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384448936
43	NC_017284	A	7	7	1670	1676	100 %	0 %	0 %	0 %	384448936
44	NC_017284	TATG	2	8	1701	1708	25 %	50 %	25 %	0 %	384448936
45	NC_017284	CAAAA	2	10	1725	1734	80 %	0 %	0 %	20 %	384448936
46	NC_017284	A	6	6	1748	1753	100 %	0 %	0 %	0 %	384448936
47	NC_017284	CAA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
48	NC_017284	AGA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
49	NC_017284	GAA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
50	NC_017284	AT	3	6	1851	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	384448937
51	NC_017284	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	384448937
52	NC_017284	AGA	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
53	NC_017284	GAA	2	6	1982	1987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
54	NC_017284	GAA	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
55	NC_017284	A	6	6	2015	2020	100 %	0 %	0 %	0 %	384448937
56	NC_017284	GAA	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
57	NC_017284	ATA	3	9	2028	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
58	NC_017284	GAA	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
59	NC_017284	A	7	7	2061	2067	100 %	0 %	0 %	0 %	384448937
60	NC_017284	A	7	7	2082	2088	100 %	0 %	0 %	0 %	384448937
61	NC_017284	TCA	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448937
62	NC_017284	ATA	2	6	2118	2123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
63	NC_017284	AAGA	2	8	2133	2140	75 %	0 %	25 %	0 %	384448937
64	NC_017284	A	6	6	2147	2152	100 %	0 %	0 %	0 %	384448937
65	NC_017284	TCA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448937
66	NC_017284	ATTT	2	8	2195	2202	25 %	75 %	0 %	0 %	384448937
67	NC_017284	TTC	2	6	2212	2217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448937
68	NC_017284	A	6	6	2247	2252	100 %	0 %	0 %	0 %	384448937
69	NC_017284	CAA	2	6	2265	2270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
70	NC_017284	AT	4	8	2382	2389	50 %	50 %	0 %	0 %	384448937
71	NC_017284	ACA	2	6	2454	2459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
72	NC_017284	GA	3	6	2491	2496	50 %	0 %	50 %	0 %	384448937
73	NC_017284	ATT	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448937
74	NC_017284	ATA	2	6	2550	2555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
75	NC_017284	TAA	3	9	2584	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
76	NC_017284	CTT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448937
77	NC_017284	ATA	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
78	NC_017284	AAG	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
79	NC_017284	GAT	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448937
80	NC_017284	CAA	3	9	2747	2755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
81	NC_017284	CAA	2	6	2769	2774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
82	NC_017284	AAC	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
83	NC_017284	A	6	6	2887	2892	100 %	0 %	0 %	0 %	384448938
84	NC_017284	A	6	6	2914	2919	100 %	0 %	0 %	0 %	384448938
85	NC_017284	A	7	7	2921	2927	100 %	0 %	0 %	0 %	384448938
86	NC_017284	GAA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448938
87	NC_017284	A	6	6	2947	2952	100 %	0 %	0 %	0 %	384448938
88	NC_017284	AGA	3	9	2957	2965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448938
89	NC_017284	A	8	8	2967	2974	100 %	0 %	0 %	0 %	384448938
90	NC_017284	AATC	2	8	2984	2991	50 %	25 %	0 %	25 %	384448938
91	NC_017284	AAATAA	2	12	2992	3003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384448938
92	NC_017284	AGAGAA	2	12	3032	3043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448938
93	NC_017284	A	6	6	3059	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	384448938
94	NC_017284	ATA	2	6	3107	3112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448939
95	NC_017284	CTTA	2	8	3131	3138	25 %	50 %	0 %	25 %	384448939
96	NC_017284	TAA	2	6	3165	3170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448939
97	NC_017284	ATG	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448939
98	NC_017284	T	6	6	3240	3245	0 %	100 %	0 %	0 %	384448939
99	NC_017284	TCTT	2	8	3309	3316	0 %	75 %	0 %	25 %	384448939
100	NC_017284	TTACC	2	10	3322	3331	20 %	40 %	0 %	40 %	384448939
101	NC_017284	AGCAC	2	10	3354	3363	40 %	0 %	20 %	40 %	384448939
102	NC_017284	ATTTGT	2	12	3388	3399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384448939
103	NC_017284	A	6	6	3482	3487	100 %	0 %	0 %	0 %	384448939
104	NC_017284	TAAAAA	2	12	3501	3512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384448939
105	NC_017284	TA	3	6	3626	3631	50 %	50 %	0 %	0 %	384448939
106	NC_017284	AGA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448939
107	NC_017284	ATAA	2	8	3703	3710	75 %	25 %	0 %	0 %	384448939
108	NC_017284	ATT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
109	NC_017284	AGA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448939
110	NC_017284	TAT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
111	NC_017284	ATT	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
112	NC_017284	ATA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448939
113	NC_017284	TAT	2	6	3942	3947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
114	NC_017284	A	7	7	3964	3970	100 %	0 %	0 %	0 %	384448939
115	NC_017284	ATT	2	6	4023	4028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
116	NC_017284	A	7	7	4092	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	384448940
117	NC_017284	TTA	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448940
118	NC_017284	AAT	2	6	4192	4197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448940
119	NC_017284	AGA	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448940
120	NC_017284	TGA	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448940
121	NC_017284	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448940
122	NC_017284	AATG	2	8	4448	4455	50 %	25 %	25 %	0 %	384448940
123	NC_017284	ATT	2	6	4503	4508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
124	NC_017284	AAT	2	6	4514	4519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
125	NC_017284	TTTA	2	8	4522	4529	25 %	75 %	0 %	0 %	384448941
126	NC_017284	ATT	2	6	4542	4547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
127	NC_017284	TTA	2	6	4560	4565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
128	NC_017284	T	6	6	4683	4688	0 %	100 %	0 %	0 %	384448941
129	NC_017284	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448941
130	NC_017284	A	6	6	4803	4808	100 %	0 %	0 %	0 %	384448941
131	NC_017284	ATA	2	6	4812	4817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
132	NC_017284	AAATA	2	10	4828	4837	80 %	20 %	0 %	0 %	384448941
133	NC_017284	TGG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448941
134	NC_017284	CAC	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448941
135	NC_017284	ATTT	2	8	4918	4925	25 %	75 %	0 %	0 %	384448941
136	NC_017284	A	6	6	4975	4980	100 %	0 %	0 %	0 %	384448941
137	NC_017284	A	7	7	4994	5000	100 %	0 %	0 %	0 %	384448941
138	NC_017284	TAA	2	6	5006	5011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
139	NC_017284	TAT	2	6	5020	5025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
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